En las profundidades de las alcantarillas de Nueva York, cuatro tortugas comunes se ven transformadas para siempre tras entrar en contacto con una misteriosa sustancia mutagénica conocida como Ooze. El resultado: Leonardo, Donatello, Miguel Ángel y Rafael, ahora adolescentes mutantes, capaces de hablar, razonar… y dominar el arte del ninjutsu.

Bajo la guía de Splinter, una sabia rata que también mutó y que actúa como su maestro y figura paterna, las tortugas se convierten en héroes anónimos decididos a proteger su ciudad. Pero su mayor desafío surge cuando se enfrentan al temible Shredder, líder del siniestro Clan del Pie, una organización criminal que amenaza con sumir a Nueva York en el caos total.

Con valentía, humor y acción a raudales, estas cuatro carismáticas tortugas deben aprender a trabajar en equipo y enfrentar su destino como defensores de la justicia… desde las sombras.