Apenas un día después de regresar del pasado, Batman y sus aliados se enfrentan a una realidad distorsionada: la isla de Japón ha desaparecido del mapa y no hay rastro de los héroes de la Liga de la Justicia. Algo ha salido terriblemente mal… y el mundo que conocían ya no existe.

Antes de que puedan comprender el caos que los rodea, una nueva amenaza cae—literalmente—del cielo: una lluvia de yakuza desata el conflicto. En esta impactante secuela del aclamado anime 3D Batman Ninja, el Caballero Oscuro deberá enfrentarse a una fuerza sobrenatural y descubrir qué conexión existe entre la desaparición de sus aliados y el surgimiento de una temible Yakuza League.